Chez plusieurs espèces d'oiseau les parents enlèvent les fientes du nid dans ce qu'on appelle des sacs fécaux. Pour ne pas attirer les prédateurs près du nid, ils vont les jeter plus loin et souvent dans des lacs, des étangs ou des piscines. Parfois aussi sur des voitures.
La période de nidification n'est pas très longue donc c'est un problème termporaire. Couvrir la piscine pourrait réduire le problème si la toile ne ressemble pas à de l'eau.
Sinon je ne vois pas comment éviter ce désagrément. Désolé!